Wenn du wirklich eine komplett neue, separate SSD für die neue Installation nutzt, und nur die UEFI Auswahl des Boot-Datenträgers benutzen möchtest (so verstehe ich das jetzt), kannst du einfach die alte SSD für die Installation abklemmen, dann wird sich definitiv nichts an der vorhandenen Installation ändern, und die neue wird nichts davon wissen.
Sollte es dann im Nachhinein den Win-Bootmanager aktivieren, kannst du den aber auch ausschalten